De la biologie à la médecine personnalisée Mieux soigner demain ? De la biologie à la médecine personnalisée Mieux soigner demain ?Béatrice Desvergne

-Résumé

Ce livre est issu de mes réflexions sur la démarche du chercheur en biologie, telle que j’ai pu l’observer au cours des vingt-cinq dernières années. Avec des avancées majeures et des réalisations magnifiques, mais aussi des espoirs non aboutis qui forcent le scientifique à développer de nouveaux outils et à inventer de nouveaux concepts.
Biologiste et médecin, à la paillasse depuis de longues années, ma propre démarche est faite d’humilité. Ces pages ne traitent donc guère de philosophie ou d’histoire des sciences, pour lesquelles on renverra le lecteur aux ouvrages ad hoc, mais se veulent très concrètes sur les pratiques scientifiques en biologie et sur ce qui fait toute leur valeur, non seulement en sciences, mais aussi pour la société.
Ces vingt-cinq dernières années ont été une période fascinante pour les chercheurs qui ont vécu les succès de la biologie moléculaire, ont contribué à leur richesse, mais qui, aujourd’hui, en constatent les limites. Ces quinze dernières années, les approches omiques (fondées sur des techniques permettant de quantifier toutes les variables d’un type donné dans un système biologique donné) ont progressivement changé le contexte du travail du biologiste et sont associées à de nouvelles approches, dites de système. Certains parlent de révolution, d’autres de simple transformation technique.

Indépendamment des nouvelles promesses politiques ou stratégiques contenues dans ces approches, qu’en est-il du point de vue de l’opérateur qu’est le chercheur ? Les approches bio-informatiques, mathématiques et/ou logiques, sont nécessaires pour donner du sens au déluge de données fournies par les nouvelles techniques omiques*, à travers notamment des essais de modélisation. Mais les réponses apportées par cette modélisation doivent rester contextualisées. Là aussi, le chercheur doit savoir rester humble, tout en conservant cet enthousiasme qui lui permet de repousser les limites.
La biologie des systèmes a aussi fait entrevoir une nouvelle approche de la médecine. Si la médecine des systèmes reste dans le champ de la recherche, la médecine dite personnalisée ou de précision, qui s’en inspire, est aujourd’hui à l’agenda de tous les pays. La médecine personnalisée s’ancre en premier lieu dans la possibilité, pour chacun, d’obtenir la connaissance de son génome*. Celui-ci est supposé fournir les données majeures des risques encourus par chaque individu face aux maladies, notamment aux maladies chroniques et invalidantes. Un ancrage très génocentré qui s’appuie donc subtilement sur ce que la biologie moléculaire et la biologie des systèmes nous ont appris. Que pouvons-nous vraiment espérer de cette médecine, et que devons-nous faire pour qu’elle puisse se réaliser ?

-Table des matières

Avant-propos

Chapitre 1 – La démarche scientifique en biologie moléculaire. Sa puissance et ses limites

Points clés

La biologie moléculaire, une révolution

Le dogme central de la biologie moléculaire et ses outils

La démarche scientifique en biologie moléculaire 

Réalisations et défis en biologie moléculaire

Les publications : témoins d’une linéarité

Que faire pour dépasser les limites de la biologie moléculaire ?

Chapitre 2 – L’arrivée des omiques et l’émergence de nouveaux concepts

Points clés

Principaux omiques développés en biologie et en recherche biomédicale

Du rêve à la réalité : l’utilisation actuelle des omiques

Les nouveaux défis liés aux omiques

Conclusion

Chapitre 3 – La biologie des systèmes et la modélisation du vivant. Décrire, expliquer, prédire

Points clés

Biologie des systèmes : de quoi parlons-nous ?

Les différents types de modèles en biologie

Que veut-on modéliser ?

Modéliser, avec quels outils ?

Quels défis aujourd’hui pour la modélisation ?

Quelques questions conceptuelles sur l’activité de modélisation

Chapitre 4 – Mégadonnées et médecine personnalisée. Réalités, promesses… et leurre ?

Points clés

Émergence de la médecine personnalisée

La génomique au cœur de la médecine personnalisée

Les succès de la médecine personnalisée

Défis scientifiques

Les questions éthiques, légales et sociétales de la médecine personnalisée

Devons-nous développer la médecine personnalisée ?

Quelques mots pour conclure

Références

Glossaire